超聲波破碎儀在處理低表面張力液體時不得使用帶螺紋端和可更換的端頭的探頭，基于超聲波在液體中的空化作用，換能器將電能量通過變幅桿在工具頭頂部液體中產生高強度剪切力，形成高頻的交變水壓強，使空腔膨脹、爆炸將細胞擊碎。另一方面由于超聲波在液體中傳播時產生劇烈地擾動作用，使顆粒產生很大的加速度，從而互相碰撞或與器壁互相碰撞而擊碎。上述作用亦足以使兩種不相溶液體混合均勻。
能達到一般的機械攪拌或搗碎所達不到的效果，故在破碎動植物組織、病毒細菌和其它細胞結構以及在乳化分離、均質等化學反應過程中，超聲波細胞粉碎儀還被廣泛應用在生物化學、醫學制藥、食品檢測、環保監測等領域。
超聲波破碎儀使用注意事項：
1、嚴禁變幅桿未插入液體內(空載)時開機，否則會損壞換能器或超聲發生器。
2、應安放在干凈、干燥處，不可放置在潮濕、高溫、灰塵及有腐蝕性氣體的地方
3、對各種細胞破碎量的多少，時間長短，功率大小，有待用戶根據各種不同細胞再摸索確定，選取最準確值。
4、建議采用短時間多次粉碎，超聲時間在5秒以內，間隔時間在5秒以下。
5、在打開發生器機殼后切勿亂摸，以防觸電。
6、當由于外部信號出現故障或出現保護指示情況時，保護指示燈亮，儀器停止工作，提示工作人員排除故障，待故障排除后按保護復位鍵恢復正常工作。
7、功率表顯示的數值與電壓、變幅桿插入液面深度及負載與被破碎樣品的濃度、稠度有關，變幅桿插入液面較深，負載濃度較大，顯示數值可能要稍小，反之稍高。
8、每次使用后請及時填寫超聲波細胞粉碎儀使用記錄。
